Le parc national de Komodo s'étend sur 1 733 kilomètres carrés d'îles volcaniques et de détroits riches en coraux entre Flores et Sumbawa, et a été créé en 1980 pour protéger le plus grand lézard vivant au monde. Les dragons de Komodo (Varanus komodoensis) atteignent trois mètres de long et 90 kilogrammes ; ce sont des prédateurs au sommet de la chaîne alimentaire dont l'isolement évolutif sur ces îles remonte à quatre millions d'années. Les limites terrestres du parc abritent environ 2 500 dragons à travers Komodo, Rinca et Padar, tandis que ses zones marines abritent 260 espèces de coraux et des corridors pélagiques utilisés par les raies manta, les requins de récif et les baleines migratrices. L'UNESCO a désigné l'archipel comme site du patrimoine mondial en 1991, reconnaissant à la fois sa mégafaune endémique et sa position à la confluence des domaines marins indien et pacifique. Labuan Bajo, le port de pêche de l'ouest de Flores, est devenu la porte d'entrée du parc après l'extension de sa piste en 2015, reliant la ville à Bali et Jakarta. Des départs quotidiens en bateau transportent désormais les visiteurs à travers le détroit de Sape vers les plateaux de savane de Rinca, où les guides mènent des randonnées surveillées devant des dragons se prélassant près des points d'eau, et vers les sentiers plus longs de l'île de Komodo à travers la forêt de mousson et sur les crêtes dominant des baies bondées de goélettes traditionnelles pinisi. La renommée marine du parc repose sur des sites de plongée comme Batu Bolong et Manta Point, où les courants forts canalisent les nutriments vers des récifs peu profonds et des stations de nettoyage fréquentées par des raies dont l'envergure dépasse quatre mètres. Pink Beach, nommée pour son sable composé de fragments de coquillages teintés par des foraminifères rouges, permet de faire de la plongée avec tuba au-dessus de jardins de corail dur à distance de nage du rivage. L'île de Padar, inhabitée depuis les années 1970, offre le panorama le plus reconnaissable du parc : trois baies en croissant séparées par des crêtes en lame de couteau, les dégradés de sable passant du blanc au noir puis au rose selon le substrat volcanique de l'anse. L'ascension de 30 minutes jusqu'au point de vue au sommet débute avant l'aube sur la plupart des itinéraires, afin de capturer la première lumière sur la mer de Flores. Les frais de conservation (250 000 IDR par visiteur étranger et par jour) financent les patrouilles des rangers et les efforts de lutte contre le braconnage ; la pêche illégale et le dynamitage des coraux ont sensiblement diminué après le renforcement des mesures d'application en 2018. Le parc reste ouvert toute l'année, bien que la saison sèche, d'avril à novembre, apporte des mers plus calmes et une meilleure visibilité sous-marine, tandis que la mousson du nord-ouest, entre décembre et mars, peut entraîner la fermeture sans préavis de certains mouillages et itinéraires de randonnée.