Der Komodo-Nationalpark erstreckt sich über 1.733 Quadratkilometer auf 29 Vulkaninseln zwischen Sumbawa und Flores. Er wurde 1991 zum UNESCO-Weltkulturerbe erklärt, da er die Heimat der weltweit größten lebenden Echsenart ist. Der Komodowaran (Varanus komodoensis) erreicht eine Länge von drei Metern und ein Gewicht von 70 Kilogramm; er stammt von australischen Waranen ab, die während des Pleistozäns über Landbrücken einwanderten. Wissenschaftler schätzen, dass weniger als 6.000 Exemplare auf Komodo, Rinca, Gili Motang und der Küste von Flores leben. Die Populationen werden von Parkrangern überwacht, die die Abstammung anhand von Schuppenmustern und genetischen Markern verfolgen. Labuan Bajo entwickelte sich zum Eingangshafen, nachdem der Trans-Flores-Highway 1986 den Regierungsbezirk West Manggarai erreichte, und verwandelte ein Fischerdorf mit 2.000 Einwohnern in ein Zentrum für jährlich 150.000 Besucher. Traditionelle Phinisi-Schoner – hölzerne Segelschiffe, die von Bugis-Schiffbauern in Südsulawesi gefertigt wurden – operieren heute neben Schnellbooten aus Glasfaser. Ihre zwei Masten und Bugspriete bahnen sich ihren Weg durch die Kanäle zwischen den Gebirgskämmen von Padar und den Korallenwänden vor Manta Point. Die marine Biodiversität der Region steht der von Raja Ampat in nichts nach: 1.000 Fischarten, 260 Korallenarten und wandernde Populationen von Mantarochen, die sich von April bis November an Putzerstationen versammeln. Pink Beach verdankt seinen Namen den Foraminiferen, einzelligen Organismen, deren rote Kalziumkarbonat-Skelette sich mit dem weißen Sand vermischen. Dies ist bei Ebbe sichtbar, wenn der Strand unter der Brandung rosafarben leuchtet. Der Aussichtspunkt der Bucht von Padar Island liegt 200 Meter über dem Meeresspiegel und ist über einen Serpentinenpfad durch Savannengrasland zu erreichen, das von den Feuern der Trockenzeit versengt wurde. Die Landschaft wandelt sich innerhalb weniger Kilometer vom trockenen Dornenwald zu Mangroven-Ästuaren, geformt durch Niederschlagsgradienten, die von 1.500 Millimetern an der Nordküste von Flores auf 800 Millimeter auf der windabgewandten Seite sinken. Bootsfahrten vor Flores, Indonesien, priorisieren frühe Abfahrten – die meisten Schiffe verlassen den Hafen von Labuan Bajo bis sechs Uhr morgens –, um Rinca oder Komodo vor der Mittagshitze zu erreichen, welche die Aktivität der Warane verlangsamt. Naturschutzgebühren finanzieren Ranger-Patrouillen, Anti-Wilderei-Initiativen und Partnerschaften mit Dörfern, die den Eierhandel durch Einkünfte aus dem Ökotourismus ersetzt haben. Der Park verzeichnete im Jahr 2025 null Wilderei-Vorfälle, eine Umkehrung der Situation aus den 1970er Jahren, als die Waran-Populationen vor Inkrafttreten der Schutzmaßnahmen um 30 Prozent zurückgegangen waren.